由北京博星投资顾问有限公司担任顾问的方正科技配股，认购缴款工作于2006年12月28日结束。

本次方正科技配股共计可配股份总数为291,134,108股，采用网上定价发行的方式，配售对象均为无限售条件的股东。截至股权登记日收市，公司原股东持股总量为970，447，028股，截至认购缴款结束日有效认购数量为270，816，197股，占本次可配股份总数（291，134，108股）的93.02%，认购金额为720，371，084.02元。

本次配股方正科技控股股东北大方正集团有限公司及其关联人方正产业控股有限公司、深圳市方正科技有限公司履行了认配股份的承诺，同时网上认购配股数量为270，816，197股，占本次可配股份总数（291，134，108股）的93.02%，超过了中国证监会《上市公司证券发行管理办法》中关于原股东认购股票的数量未达到拟配售数量百分之七十”视为发行失败的限制，故本次发行成功。